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对有机硝酸盐的过敏反应极为罕见，但确实会发生。对异硝酸异山梨酯或其任何其他成分过敏的患者禁用艾索地尔。

硝酸异山梨酯的不良反应通常与剂量有关，并且几乎所有这些反应都是硝酸异山梨酯作为血管扩张剂的活性的结果。头痛可能很严重，是最常见的副作用。每天服用，尤其是高剂量服用时，头痛可能会复发。也可能发生短暂的头晕发作，偶尔与血压变化有关。

低血压很少发生，但在某些患者中可能严重到足以中断治疗。晕厥，渐进性心绞痛和反弹性高血压已有报道，但并不常见。

极少数情况下，普通剂量的有机硝酸盐会在看起来正常的患者中引起高铁血红蛋白血症。在这些剂量下，高铁血红蛋白血症很少见，因此推迟了对其诊断和治疗的进一步讨论（请参见过量 ）。

数据是不可用的，以允许与Isordil®舌下片剂治疗期间的不良反应的频率的估计。